就在张燮率第一分舰队主力同普特曼斯在闽江口外海激战时，收到荷兰舰队从南澳岛北上情报的郑芝龙，终于率领台海巡检司的主力返回了厦门岛。
看着自己留在厦门岛的船只被摧毁了大半，郑芝龙也极为愤慨。不过他并没有因此责备自己留守厦门的亲信施福，而是积极的整理手中的力量，准备北上同联合舰队一起围歼这只肆虐了厦门的荷兰舰队。
不过郑芝龙尚未出发，便收到了来自福州的消息，是联合舰队已经在闽江口同荷兰舰队初战获胜，要求其固守厦门，准备拦截南逃的荷兰舰队。
虽然不明白本该从济州岛出发的联合舰队为什么会这么快出现在福州外海，但是己方舰队已经挫败荷兰舰队的消息，顿时激发了郑芝龙部下的求战之心。
郑芝龙也顺势利导的利用这一消息督促部下备战，并放出了大量渔船作为自己的耳目。五月十四日中午，郑芝龙的哨探终于发现了南下的荷兰舰队行踪。
熟悉厦门海域地理的郑芝龙很快就断定，按照荷兰舰队的航行速度，对方必然会在金门岛附近停泊过夜。于是他在金门附近安置了几艘渔船，以确定荷兰舰队的停泊地点，自己这边则开始整军备战。
当日黄昏时分，郑芝龙的哨探看到荷兰舰队在金门岛南面的料罗湾下碇停泊之后，便迅速驾船返回了厦门，向郑芝龙报告了自己的发现。
郑芝龙和部下们商议了一个多时后，终于决定在明日凌晨突击荷兰饶锚地。在第二日凌晨三时左右，郑军起身用饭登船，将近五时，船只开始驶出厦门港道。
从厦门港到金门岛南部的料罗湾，不过35公里上下，郑军舰队花费了2个时抵达了料罗湾西面，随即在此整军列阵，方才向着3公里外的荷兰舰队锚地冲去。
福州外海的挫败让荷兰人士气大衰，这并不是因为明军舰队的强大所至，而是在于他们明明拥有着数量上的优势，却被明军舰队从容不迫的戏耍挫败，这让荷兰舰队的成员们开始怀疑起舰队司令普特曼斯的能力来了。
当普特曼斯下令舰队南撤时，这条命令其实还是引起了不少荷兰船长的质疑的。因为初次接战时的挫败并没有改变荷兰舰队对于明军这只舰队的优势，他们还是可以同明军舰队再次交战下去的。
可如果他们就此退去的话，就无疑是放弃了此前出战时的目标，让这场战争无止境的蔓延下去，这对于巴达维亚来是极为不利的局面。
但普特曼斯也对此无可奈何，舰队的物资不足是一个方面，另一方面是大多数船长在失败后都萌生了退意。荷兰东印度公司毕竟是一个商业公司，巴达维亚此次聚集起来的船只大部分都是武装商船，这些商船的主人是来东方寻求财富的，而不是来为公司作战的。
当公司的实力远远超过公司的敌人时，这些商船的船主自然会兴高采烈的跟随公司出战分上一杯羹。但是像如今这样，对方具有不弱于公司的力量时，船主们就要考虑，继续作战下去是否符合自己的利益了。