孙传庭告诉蒙古族士兵，既然加入大明朝的军队，一切都要以军队的纪律要求自己，必须严格按照制定的作战方式和技巧去战斗，决不允许逞英雄私自去凭自己的蛮力格杀，必须讲究战友之间的技巧配合，从此以后不再有单兵之间的格杀，有的只是一小队十人为整体的集体对抗，依靠集体的力量，最大限度的消灭敌人和保护自己。在集体作战时，无论任何时候都要保持在局部战斗中形成以多打少的局面，当第一个人射击时，后面的人马上就要迅速插到敌人侧面劈杀；当正面敌人难以抵挡时，必须让过正面，从侧面射击，绕道背面砍杀，但是绝不允许退却。总之，尽量减少损失，获得最大的胜利。
对于汉族士兵，孙传庭则要求他们尽快熟练马匹和这里的气候，熟练掌握手中的火枪、火炮。尽快熟练马匹是因为这是快速行军的基本要求，在辽阔的东北平原和以后的西伯利亚平原，快速的行军速度将是战争取得胜利的保证，只有出其不意的攻击，才能达到最大的效果。熟悉、熟练、灵活运用火枪、火炮是取得胜利的保证，当让这些近现代化的武器发挥到极致的时候，任何这个时代的军队都是难以对抗的，孙传庭训练的目的就是让士兵达到这个要求。
科尔沁蒙古草原的夏天，一对对汉蒙士兵正在热火朝天的训练，孙传庭给他们的训练时间是三个月成军。为了保证训练质量，每个士兵的食物不加限量，只要你在这三个月中训练成合格的士兵，你可以放开肚子去吃饭，无论是牛羊肉还是米饭都随便，每天三顿饭，这对于现在的士兵来说可是天大的喜讯，要知道在现代这个年代能够吃饱饭就是天大的事。孙传庭为了防止士兵吃得太胖，还专门规定凡是不能够完成训练量，而且体重超标的士兵将被清理出军队，回家抱孩子玩去吧。结果三个月过后，这三万士兵一个个生龙活虎，战意十足，没有一个被淘汰回家的，反倒是有近百人训练造成了意外伤害，孙传庭也没有亏待他们，而是每人分了牛羊、土地回去地方担任民兵后备役教官去了。
与此同时，叶赫那拉部落部落和大明朝的关系也是空前的友好。自从赵率教帮助叶赫那拉部落击败努尔哈赤部落的进攻以后，部落的首领尼雅哈几乎天天都找赵率教喝酒，只喝得赵率教看见尼雅哈就想躲着走。好歹这个时候熊廷弼把满桂派了过来，同时还有新任命的总兵毛文龙，满桂还好一点，不好这一口，毛文龙却是荤素不论，女人和酒全部接受，尤其是喝酒，简直把尼雅哈都喝怕了，好在还有满桂调和着，这几个人关系处的非常的融洽。
当熊廷弼把朝廷的意思向尼雅哈说明之后，尼雅哈也觉得能够定居下来，并且成为大明朝的一份子，这对于吃尽了缺粮少盐的部族来说，绝对是最好的好事。尼雅哈就把部落里的长老们们都请到了自己的帐篷里协商，这些长老们早就被明军的火器惊呆了，尤其是努尔哈赤的残忍屠杀更让他们有恨又怕，巴不得找到一个大靠山，现在大明朝提出这个条件还比较优厚，不但供粮、供盐，而且还收购土产品，供给日常生活用品，还让孩子们读书认字，于是稍加商议就同意了加入大明朝的序列。