对于参战的军士和锦衣禁军，朱由榔也不薄待，总兵、都指挥使以下至大头兵，凡打死射死一名参将的赏银五百两，打死射死一名游击的赏银三百两，以下依次递减。
并且从总兵、都指挥使以下至普通营兵禁卫，战死战赡都规定了抚恤和慰问的金额，并派专人计数造册，不许遗漏。
这一连串的激励下来果然很起作用，勤王军和锦衣禁军，上到统帅焦琏，吴继嗣等，下到军校卒，一片欢欣鼓舞，斗志高昂，士气可用。
陈氏父子伏法，内患解除后，朱由榔君臣终于可以全心全力对抗即将攻入广西梧州行在的清军了，据前线塘报，李成栋已经平定了粤东义军的反抗，于两日前全军返回到了肇庆，正在集结兵力，择日向梧州进发。
梧州在肇庆之西，以一条西江相连，直线距离六百余里，大军水陆并进，十日左右可达。军情紧急，接下里的日子里，子下令宣告全城，将誓死守卫国门，大战即将来临，同时发动州城百姓们坚壁清野，积极备战。
外患迫在眉睫，为了减少渠道流程，提高军政效率，避免各部扯皮，朱由榔亲立行都四面防御司，御虏之事统规防御司处断，其他机构不得掣肘，以翟式耜为防御使，总理行在防务大事。
翟式耜也不负所望，以原总兵衙门为官邸，同时辟除一大批幕僚官，其中不乏四五品朝官在内，皆甘愿为翟式耜驱使。
上任后，翟式耜即下令修治梧州城四壁，编练保甲，动员军民百姓即速完成修筑敌楼，安顿炮座，设立弩床，搬运砖石，配置火油、布置鹿角、铁蒺藜、挖馅军坑，清理护城河、外壕等等防御事宜，再次宣布子坚守的决心，以鼓舞军民奋力抗虏。
加固城防的同时，陈部近万降军也在全力整顿消化，剔除兵痞、老弱和铁杆死忠派后，留下五千精壮。其中战力最弱的三千编为巡防营，直属于防御司，一千有些战力的并入主力焦琏部，号虎贲营，以焦琏为营统领，节制全军，虎贲营也是直属于防御司，不归内阁兵部调遣；剩余一千没什么恶习的良家子以平乱中剩余的一百余锦衣禁军为骨干，单独成立一营，号近卫营，以吴继嗣为营统领，直接听命于子。
大战就要来临，各营人马都在努力操练磨合，消化力量，临战之时，不能兵不知将，将不知兵。
朱由榔亲自微服巡城，检查城池的守备工作，在城头上呆到用膳时，内监们送来御膳，他下令撤了，取来营兵的伙食，与营兵们一块吃，期间他又查问了每个军士的衣着，发现他们在寒冷的深冬竟然半数没有棉袄，有的也大多是旧的，穿了不少年了，棉絮都露在外面，朱由榔闻之不禁垂泪。
回宫后他亲自拟了一份诏旨：正月严寒，军士衣着暴露，朕心实不安，皇后闻之亦感伤，特领宫人亲制棉袄五十件，发至军前，如今宫内尚在续制，防御司亦在筹集棉絮，派专人加紧缝制，务使三军尽得袄服，如此朕心慰矣！