平定了左良玉后。
丁毅任命何腾蛟继续为湖南巡抚，原吴三桂部下潘永昌为武昌总兵，率一万兵马驻守武昌（其中五千是丁毅的兵马，一半是黄蜚的水师重训而来。）防区为武昌府、汉阳府、黄州府。
黄蜚为襄阳总兵，率两万兵马（五千为丁毅，一万五千为左良玉兵马重训而来），负责襄阳府、郧阳府、荆州府、德安府、承天府防务。
吴学礼为岳州总兵，领兵五千（闯军重训，军官俱是丁毅的人。），负责岳州府、常德府的防务。
刘肇基为长沙总兵，领兵两万（左良玉部下，军官俱是丁毅的人。）负责长沙府、衡州府、宝庆府、辰州府、永州府、靖州、郴州等地的防务。
张献忠在湖南的县府纷纷被官军攻破，退往四川。
到六月底时，湖南已经到了丁毅手上。
七月中旬。
黄得功两万兵马，祖进忠和徐文虎两万兵马先后到达汉中。
汉中这边，已经云集了张经的七万大军，和后期从榆林、大同运来的大量粮草。
三路兵马汇聚后，这边已经有兵马十一万。
朝廷诸公议事时，原本准备让黄得功和祖进忠徐文上下功夫的兵马从湖广的夷陵往四川东面攻进去。
但丁毅想一战而定，怕其他明军不是张献忠的对手，必竟这时张献忠有六十万大军，手下还有名将李定国等。
他前期在汉中囤集大量粮草和资源，一直等到七月，三路兵马汇聚后，统一指挥。
此战指挥丁毅想了很久，虽然他的兵马在武器代差上远远超过农民军，但他也不想把战线拖太长。
因为这会他的所有粮草，需要从榆林和大同运过去，大明在陕西其他地方没什么粮，湖南又太远。
榆林和大同还是因为他之前在那边囤田囤的好的原因。
但囤的再好，粮食也有限，肯定不能拖太长，要速战速决。
最后丁毅决定，让王卫忠指挥，调回张经。
张经资历比王卫忠老，上次打西安可以指挥，这次是数十万人的大决战，不容有失。
丁毅调任张经暂时为江西南昌总兵，命他带五千东江本部兵马先到安庆，然后把湖南另两万左良玉的兵马带上，一起进江西在那边集训，等扫平张献忠后，有徐文虎去接替南昌总兵，张经则回京师。
这样前面汉中的丁毅兵马为十万五千左右，主帅为王卫忠。
明军守五千兵马驻守汉中，十万兵马从汉中入川。
入川后并不急着找张献忠决战，反而摆出一副害怕和躲闪的模样。
按丁毅的战略，先往南攻占保宁府，然后分兵一万往东攻占夔州府，两府各留一万兵马驻守。
八万兵马往南继续，先打顺庆府，再打重庆。
这四个地方打下来后，四川整个东部就连成一片。